根據財稅〔2017〕37號 第二條：納稅人購進農產品，按下列規(guī)定抵扣進項稅額：

   ①納稅人購進農產品,取得一般納稅人開具的增值稅專用發(fā)票或海關進口增值稅專用繳款書的，以增值稅專用發(fā)票或海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額為進項稅額;

②從按照簡易計稅方法依照3%征收率計算繳納增值稅的小規(guī)模納稅人取得增值稅專用發(fā)票的，以增值稅專用發(fā)票上注明的金額和11%的扣除率計算進項稅額；

③取得（開具）農產品銷售發(fā)票或收購發(fā)票的，以農產品銷售發(fā)票或收購發(fā)票上注明的農產品買價和11%的扣除率計算進項稅額。

考慮到兩次增值稅稅率的變動，其中最后一次是根據財政部稅務總局 海關總署公告2019年第39號規(guī)定：

納稅人購進農產品，原適用10%扣除率的，扣除率調整為9%。

由此可得，納稅人購進農產品，從按照簡易計稅方法依照3%征收率計算繳納增值稅的小規(guī)模納稅人取得增值稅專用發(fā)票的，以增值稅專用發(fā)票上注明的金額和9%的扣除率計算進項稅額；

根據財政部稅務總局公告2020年第13號規(guī)定：

自2020年3月1日至2020年12月31日，對湖北省增值稅小規(guī)模納稅人，適用3%征收率的應稅銷售收入，免征增值稅;除湖北省外，其他省、自治區(qū)、直轄市的增值稅小規(guī)模納稅人，適用3%征收率的應稅銷售收入，減按1%征收率征收增值稅。

由此可得，納稅人購進農產品，從按照簡易計稅方法依照1%征收率計算繳納增值稅的小規(guī)模納稅人取得增值稅專用發(fā)票的，以增值稅專用發(fā)票上注明的金額和9%的扣除率計算進項稅額；

財政部稅務總局 海關總署公告2019年第39號規(guī)定：

在領用農產品環(huán)節(jié)，如果農產品用于生產或者委托加工13%稅率貨物，則加計1%進項稅額。

比如，10月份購進一批農產品，購進時按照9%計算抵扣進項稅額；11月份領用時，確認用于生產13%的稅率貨物，則在6月份再加計1%進項稅額。

會計處理如下：

采購時：

借：原材料 【②-①】

    應交稅費-應交增值稅（進項稅額）【農產品收購發(fā)票、銷售發(fā)票買價或小規(guī)模納稅人專票價款】*9%①

    貸：銀行存款【農產品收購發(fā)票、銷售發(fā)票買價或小規(guī)模納稅人價稅合計】②

領用時：

借：生產成本【③-（②-①）】

    應交稅費-應交增值稅（進項稅額）【農產品收購發(fā)票、銷售發(fā)票買價或小規(guī)模納稅人專票價款】*1%③

貸：原材料【②-①】

需要說明的是：

取得批發(fā)零售環(huán)節(jié)納稅人銷售免稅農產品開具的免稅發(fā)票，以及小規(guī)模納稅人開具的增值稅普通發(fā)票，均不得計算抵扣進項稅額。